CSU Neptun Constanța are în prezent urmatoarele secții per ramură de sport: arte marțiale, atletism, baschet, canotaj, handbal, kaiac-canoe, modelism, natație, yachting, conform Cerificatului de identitate sportivă cu numărul CT/A1/00003/2012. Dintre acestea, ca secții active sunt handbalul, baschet 5 la 5 și baschetul 3X3. Activitatea sportivă se desfășoară pe raza municipiului Constanta, în Sala Sportuilor "Simona Amânar", precum și în sala Hidrotehnica a Universității Maritime din Constanța.
În anul 2023, s-au aflat în pregătire un număr de 77 de sportivi legitimați. Activitatea competițională a inclus participarea sportivilor în Campionatele Naționale pe ramura de sport, precum și la alte competiții oficiale interne din calendarele competiționale ale federațiilor.
CSU Neptun Constanța are o bună relație de colaborare cu structurile sportive din Județul Constanța și în baza unor protocoale de colaborare în ultimii ani, a reușit să eficientizeze cheltuielile cu activitatea sportivă și obținerea unor rezultate deosebite la nivel național și internațional.
Din numărul celor 77 sportivi ce au evoluat pentru CSU Neptun Constanța în anul 2023, 28 sunt studenți și 13 sunt elevi.
